Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q66JV7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q66JV7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q66JV7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q66JV7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms