Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf1Q64213 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms