Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp1Q62209 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms