Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms