Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprrQ62132 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms