Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga6Q61739 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms