Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itm2aQ61500 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms