Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms