Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JrkQ60976 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms