Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RelnQ60841 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms