Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms