Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4F6

Wdr34, WD repeat-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr34Q5U4F6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr34Q5U4F6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr34Q5U4F6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms