Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc5a6Q5U4D8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms