Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms