Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms