Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms