Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms