Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sco1Q5SUC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms