Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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