Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms