Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms