Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms