Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms