Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5EBG8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms