Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms