Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdv3Q4VAA2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms