Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms