Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc114Q3UX62 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms