Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms