Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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