Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms