Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TceancQ3US16 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms