Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc190Q3URK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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