Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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