Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctsll3Q3ULP7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms