Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc61Q3UJV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms