Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms