Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms