Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms