Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms