Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms