Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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