Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hhla1Q3TYV2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hhla1Q3TYV2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms