Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccbe1Q3MI99 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms