Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Treml4Q3LRV9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Treml4Q3LRV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Treml4Q3LRV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms