Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3KNL4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3KNL4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms