Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc162pQ0VG85 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms