Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col19a1Q0VF58 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms