Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms