Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmbpQ07456 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms